Genetyczna identyfikacja nowych szczepów wirusa Zachodniego Nilu

Naukowcy z UConn ustalili skład genetyczny szczepów wirusa Zachodniego Nilu występujących u alpak i wron.

Wyniki te zostały opublikowane w Granice w naukach weterynaryjnych.

W 2021 r. do CVMDL przywieziono osiem przypadków wirusa Zachodniego Nilu w celu postawienia diagnozy — siedem ptaków, zarówno domowych, jak i dzikich — oraz jeden przypadek alpaki.

mówi Natalie Tocco 23 (CAHNR), rezydent patologii anatomicznej na Wydziale Biologii Patologicznej i Nauk Weterynaryjnych.

Spośród ośmiu przypadków alpaka z Massachusetts i wrona z Connecticut miały największą ilość wirusa w swoich systemach w momencie diagnozy.

Koncentrując się na tych dwóch przypadkach, naukowcy byli zainteresowani sprawdzeniem, czy istnieją różnice genetyczne między wirusami, ponieważ występowały one u różnych gatunków w różnych stanach.

Po zsekwencjonowaniu całych genomów wirusów naukowcy porównali je z istniejącymi danymi. Odkryli, że wirus Zachodniego Nilu u wron był podobny do wirusa zidentyfikowanego u komarów i ptaków w Nowym Jorku w latach 2007-2013. Wirus u alpak był podobny do wirusów Zachodniego Nilu znalezionych u komarów w Nowym Jorku, Teksasie i Arizonie. W latach 2012-2016.

„[These findings] Pokazuje różnorodność rozprzestrzeniających się szczepów, które mogą naprawdę zmienić to, co obserwujemy w populacjach komarów w różnych regionach” – mówi Tocco.

Informacje te mogą pomóc naukowcom przewidzieć, gdzie mogą pojawić się różne szczepy wirusa, biorąc pod uwagę, w jaki sposób komary i ptaki poruszają się po kraju.

Autorzy doszli do wniosku, że różnice w składzie genetycznym tych wirusów wskazują, że preferencje żywieniowe wektora gospodarza prawdopodobnie napędzają przenoszenie wirusa. Różne gatunki komarów wolą żerować na różnych żywicielach zwierzęcych. Prowadzi to do zakażenia wirusem Zachodniego Nilu wielu gatunków zwierząt.

Zrozumienie składu genetycznego wirusów może umożliwić naukowcom, diagnostom i weterynarzom lepsze zrozumienie, które zwierzęta mogą być bardziej podatne na wirusa, nasilenie choroby i jak mogą wyglądać objawy.

„Może otworzyć całą puszkę robaków” – mówi Tocco. „W rzeczywistości myślę, że musimy przeprowadzić więcej badań na ten temat, aby zobaczyć, co znajdujemy i jakich wzorców powinniśmy się spodziewać w odniesieniu do różnych szczepów i jakiego rodzaju choroby obserwujemy u nich”.

Wirus Zachodniego Nilu został po raz pierwszy wykryty w Nowym Jorku w 1999 roku i szybko rozprzestrzenił się po całym kraju. Do roku 2000 znajdował się w Connecticut. Od tego czasu Zachodni Nil pozostaje problemem zdrowia publicznego w Stanach Zjednoczonych

Na początku XXI wieku CVMDL opublikował jeden z pierwszych artykułów na temat wirusa Zachodniego Nilu w Stanach Zjednoczonych

„Oprócz bycia tutaj, w Connecticut i bycia problemem zdrowia publicznego, przynosi to również większą różnorodność do laboratorium, aby przywrócić badania Zachodniego Nilu na pierwszy plan dzięki wykorzystaniu naszych przypadków diagnostycznych” – mówi Tocco.

Chociaż ten artykuł skupiał się tylko na dwóch stanach, naukowcy pracują obecnie nad innym artykułem, aby przeanalizować określone objawy ze wszystkich ośmiu warunków.

Liczba przypadków wirusa Zachodniego Nilu obserwowanych przez CVMDL zmienia się każdego roku. Podczas szczególnie wilgotnych lat, które są idealne dla komarów, mają tendencję do obserwowania większej liczby przypadków. W 2022 roku zdiagnozowanych zostanie 30 przypadków.

Ptaki – a zwłaszcza krukowate, takie jak kruki, kruki i kawki – są powszechnymi wektorami wirusa Zachodniego Nilu.

Najczęstsze objawy Zachodniego Nilu u tych zwierząt to drgawki, niemożność wstania, objawy neurologiczne i objawy oczne. Objawy oczne są szczególnie częste u ptaków drapieżnych, takich jak orły, sowy i jastrzębie. Ptaki drapieżne mogą również zachorować na chorobę serca spowodowaną wirusem.

„Istnieje wiele zmian chorobowych, które możemy zaobserwować w przypadku Zachodniego Nilu, więc chodzi o to, aby być bardziej proaktywnym w przypadku tej diagnostyki w określonych porach roku i pozostawać w stanie wysokiej gotowości, ponieważ u niektórych zwierząt nie są to tylko oznaki układu nerwowego” – mówi Tocco .

Najczęstszym okresem występowania wirusów Zachodniego Nilu jest okres od sierpnia do października. Jednak w miarę ocieplania się klimatu w Connecticut zasięg Zachodniego Nilu rozszerza się. Toko twierdzi, że zdiagnozowano przypadki w Zachodnim Nilu od końca listopada do maja.

„Mogą to być anomalie, ale mogą wskazywać, czego możemy się spodziewać w przyszłości” – mówi Tocco. „I nie zakładać klapek na porę roku, ale rozszerzać to okno w oparciu o to, co widzimy diagnostycznie”.