SARS-CoV-2/COVID-19 w ściekach
Kolejny krok w monitoringu ścieków pod kątem SARS-CoV-2/COVID-19
Bibliografia
Dalsza lektura
Chociaż wdychanie kropelek/aerozoli i kontakt między osobami można uznać za główne sposoby przenoszenia choroby koronawirusowej 2019 (COVID-19), ostatnie badania wykazały, że koronawirus zespołu ostrej niewydolności oddechowej 2 (SARS-CoV-2) może Można go również wykryć w ściekach.
Społeczność naukowa podejmuje nowe kroki w celu zbadania ścieków jako potencjalnego źródła zagrożeń dla zdrowia ludzi oraz danych epidemiologicznych jako systemu wczesnego ostrzegania przed COVID-19.
Źródło obrazu: Viewfotostudio/Shutterstock.com
SARS-CoV-2/COVID-19 w ściekach
SARS-CoV-2, który doprowadził do kryzysu związanego z pandemią COVID-19, jest trzecim zwierzęcym koronawirusem, po epidemiach SARS-CoV i MERS-CoV. Monitoring ścieków lub środowiska to obiecująca metoda masowego monitorowania lub badań przesiewowych, która może pomóc w generowaniu przydatnych danych dla systemów wczesnego ostrzegania przed pojawiającymi się patogenami, takimi jak SARS-CoV-2.
Ostatnie doniesienia wykazały, że SARS-CoV-2 rozprzestrzenił się w szambach, ściekach i ściekach. Zezwolenia na monitorowanie ścieków Terminowe i ukierunkowane zamykanie i ponowne otwieranie w niektórych gęsto zaludnionych obszarach geograficznych o niskich zasobach.
Aby zwiększyć czułość testów wykrywających, należy stosować metody zagęszczania wirusów, takie jak flokulacja modyfikowanego mleka odtłuszczonego, system filtracji za pośrednictwem worka, ultrafiltracja przez koncentrat filtracyjny Millipore i wytrącanie glikolem polietylenowym.
Naukowiec dąży teraz do przeprowadzenia ekonomicznych badań nadzoru epidemiologicznego i posiadania doskonałych protokołów wykrywania i pomiaru SARS-CoV-2. Chociaż na całym świecie prowadzone są masowe kampanie testów RT-PCR w celu śledzenia COVID-19, niestety nie można tego długo uważać za niezawodne narzędzie nadzoru dla ogółu populacji.
Ostatnie doniesienia wykazały, że SARS-CoV-2 wykryto w kale pacjentów zakażonych COVID-19, a zakaźnego SARS-CoV-2 odnotowano w kale pacjentów z ciężkim przebiegiem COVID-19. SARS-CoV-2 można nadal wykryć w kale, nawet gdy drogi oddechowe stają się czyste lub ujemne w kierunku SARS-CoV-2, co rodzi wiele pytań o znaczenie oczyszczania ścieków przeciwko SARS-CoV-2.
SARS-CoV-2 może powodować bezobjawowe lub minimalnie objawowe infekcje, co może dodatkowo ograniczać określanie rzeczywistego stopnia rozpowszechnienia SARS-CoV-2 w społeczności.
Nie ma jasnego obrazu stopnia zanieczyszczenia środowiska i sposobu przenoszenia. Ong i in. poinformował, że pacjent z zajęciem górnych dróg oddechowych bez klinicznych objawów zapalenia płuc miał dwie dodatnie próbki kału na SARS-CoV-2 bez objawów biegunki, co sugeruje, że SARS-CoV-2 w kale może być drogą transmisji.
Dlatego niezwykle ważne jest uzyskanie większej ilości danych na temat sposobu przenoszenia COVID-19 w ściekach i ściekach, aby ocenić potencjalne zagrożenia dla pracowników sanitarnych i ogółu ludności oraz ocenić, czy monitorowanie ścieków jest idealną metodą monitorowania COVID-19 w Społeczność.
Źródło obrazu: felipecaparros/Shutterstock.com
Kolejny krok w monitoringu ścieków pod kątem SARS-CoV-2/COVID-19
Tymczasem nadzór ścieków stanowi mniej stronniczą metodę szacowania częstości występowania infekcji w różnych regionach, zwłaszcza w krajach rozwijających się z ograniczonymi zasobami na nadzór kliniczny i diagnostykę. Obecne wykrywanie SARS-CoV-2 w ściekach opiera się głównie na metodzie RT-PCR, która jest pracochłonna, kosztowna, czasochłonna i pracochłonna.
Amplifikacja izotermiczna, w której pośredniczy pętla odwrotnej transkrypcji (RT-LAMP) jest obecnie szeroko stosowany jako idealna alternatywa dla RT-PCR, ponieważ RT-LAMP jest szybkim, tanim, specyficznym, czułym i łatwym w użyciu testem. RT-LAMP może bezpośrednio wykrywać SARS-CoV-2 z próbek klinicznych bez potrzeby ekstrakcji wirusowego RNA. RT-LAMP jest obecnie używany do wykrywania SARS-CoV-2 w próbkach ścieków.
RT-LAMP ma kilka innych zalet, takich jak wyłączenie termocyklera, czułość, szybkość i solidność inhibitora próbki, co czyni go idealną alternatywą dla RT-PCR. Amplifikacja izotermiczna za pośrednictwem pętli zajmuje mniej niż godzinę, aby powielić materiał genetyczny patogenu, z czterema do sześcioma starterami zapewniającymi wysoką specyficzność.
Mikrofluidyka to nowa, jednorazowa i niedroga technologia do szybkiego diagnozowania infekcji wirusowych. Technika mikroprzepływowa stanowi alternatywę dla czasochłonnych i pracochłonnych testów laboratoryjnych.
Technologie mikroelektroniczne i systemy mikroelektromechaniczne odgrywają kluczową rolę w opracowywaniu chipów mikroprzepływowych, które mogą obsługiwać precyzyjne objętości cieczy i wydobywać z nich informacje, zapewniając możliwość szybkiego uzyskiwania informacji z dokładnej objętości próbek. Dunia i jej współpracownicy połączyli RT-LAMP i technologię mikroprzepływową, aby wykryć SARS-CoV-2 w ściekach..
Bibliografia
- Dunia, A.; Hassan, Sz. Zhang, X; Madbouly, L.; Bukhari, H.; Kryzys związany z COVID-19 stwarza szansę na globalny nadzór i nadzór. Patogeny. 2021, 10256 https://doi.org/10.3390/pathogens10030256
- Kitajima, M. i in., SARS-CoV-2 w ściekach: stan wiedzy i potrzeby badawcze. nauka o makrośrodowisku2020.739: str. 139076. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2020.139076
- Oran, DP i EJ Topol, Bezobjawowe rozprzestrzenianie się zakażenia SARS-CoV-2. Roczniki Chorób Wewnętrznych2021. 174(2): str. 286-287. https://doi.org/10.7326/M20-3012
- Alhuraimel, K i in., SARS-CoV-2 w środowisku: sposoby przenoszenia, wczesne wykrywanie i potencjalna rola infekcji. nauka o makrośrodowisku, 2020: s. 140946. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2020.140946
- Ong, Chun Weixiang, Yian Kim Tan, Bo Ying Chia, Tao Hong Lee, On Teck Ng, Michelle So Yen Wong i Kalisfar Marimuthu. „Zanieczyszczenie powietrza, środowiska powierzchniowego i środków ochrony indywidualnej przez wirusa zespołu ostrej niewydolności oddechowej 2 (SARS-CoV-2) od pacjenta z objawami”. gamma 323, nr. 16 (2020): 1610-1612
- doi: 10.1001/Zbierz.2020.3227
- Dunya, Ahmed i inni. „Integracja RT-LAMP i technologii mikroprzepływowej do wykrywania SARS-CoV-2 w ściekach jako zaawansowany punkt opieki”. bioRxiv (2021). https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.08.18.456880v2
Dalsza lektura
„Całkowity miłośnik kawy. Miłośnik podróży. Muzyczny ninja. Bekonowy kujon. Beeraholik.”
More Stories
Prognoza cukrzycy w Australii w 2024 r. | Wiadomości o Mirażu
„Gorąca sauna żabia” pomaga australijskim gatunkom w walce ze śmiercionośnym grzybem
Model sztucznej inteligencji poprawia reakcję pacjentów na leczenie raka