SARS-CoV-2/COVID-19 w ściekach
Kolejny krok w monitoringu ścieków pod kątem SARS-CoV-2/COVID-19
Bibliografia
Dalsza lektura
Chociaż wdychanie kropelek/aerozoli i kontakt między osobami można uznać za główne sposoby przenoszenia choroby koronawirusowej 2019 (COVID-19), ostatnie badania wykazały, że koronawirus zespołu ostrej niewydolności oddechowej 2 (SARS-CoV-2) może Można go również wykryć w ściekach.
Społeczność naukowa podejmuje nowe kroki w celu zbadania ścieków jako potencjalnego źródła zagrożeń dla zdrowia ludzi oraz danych epidemiologicznych jako systemu wczesnego ostrzegania przed COVID-19.
Źródło obrazu: Viewfotostudio/Shutterstock.com
SARS-CoV-2/COVID-19 w ściekach
SARS-CoV-2, który doprowadził do kryzysu związanego z pandemią COVID-19, jest trzecim zwierzęcym koronawirusem, po epidemiach SARS-CoV i MERS-CoV. Monitoring ścieków lub środowiska to obiecująca metoda masowego monitorowania lub badań przesiewowych, która może pomóc w generowaniu przydatnych danych dla systemów wczesnego ostrzegania przed pojawiającymi się patogenami, takimi jak SARS-CoV-2.
Ostatnie doniesienia wykazały, że SARS-CoV-2 rozprzestrzenił się w szambach, ściekach i ściekach. Zezwolenia na monitorowanie ścieków Terminowe i ukierunkowane zamykanie i ponowne otwieranie w niektórych gęsto zaludnionych obszarach geograficznych o niskich zasobach.
Aby zwiększyć czułość testów wykrywających, należy stosować metody zagęszczania wirusów, takie jak flokulacja modyfikowanego mleka odtłuszczonego, system filtracji za pośrednictwem worka, ultrafiltracja przez koncentrat filtracyjny Millipore i wytrącanie glikolem polietylenowym.
Naukowiec dąży teraz do przeprowadzenia ekonomicznych badań nadzoru epidemiologicznego i posiadania doskonałych protokołów wykrywania i pomiaru SARS-CoV-2. Chociaż na całym świecie prowadzone są masowe kampanie testów RT-PCR w celu śledzenia COVID-19, niestety nie można tego długo uważać za niezawodne narzędzie nadzoru dla ogółu populacji.
Ostatnie doniesienia wykazały, że SARS-CoV-2 wykryto w kale pacjentów zakażonych COVID-19, a zakaźnego SARS-CoV-2 odnotowano w kale pacjentów z ciężkim przebiegiem COVID-19. SARS-CoV-2 można nadal wykryć w kale, nawet gdy drogi oddechowe stają się czyste lub ujemne w kierunku SARS-CoV-2, co rodzi wiele pytań o znaczenie oczyszczania ścieków przeciwko SARS-CoV-2.
SARS-CoV-2 może powodować bezobjawowe lub minimalnie objawowe infekcje, co może dodatkowo ograniczać określanie rzeczywistego stopnia rozpowszechnienia SARS-CoV-2 w społeczności.
Nie ma jasnego obrazu stopnia zanieczyszczenia środowiska i sposobu przenoszenia. Ong i in. poinformował, że pacjent z zajęciem górnych dróg oddechowych bez klinicznych objawów zapalenia płuc miał dwie dodatnie próbki kału na SARS-CoV-2 bez objawów biegunki, co sugeruje, że SARS-CoV-2 w kale może być drogą transmisji.
Dlatego niezwykle ważne jest uzyskanie większej ilości danych na temat sposobu przenoszenia COVID-19 w ściekach i ściekach, aby ocenić potencjalne zagrożenia dla pracowników sanitarnych i ogółu ludności oraz ocenić, czy monitorowanie ścieków jest idealną metodą monitorowania COVID-19 w Społeczność.
Źródło obrazu: felipecaparros/Shutterstock.com
Kolejny krok w monitoringu ścieków pod kątem SARS-CoV-2/COVID-19
Tymczasem nadzór ścieków stanowi mniej stronniczą metodę szacowania częstości występowania infekcji w różnych regionach, zwłaszcza w krajach rozwijających się z ograniczonymi zasobami na nadzór kliniczny i diagnostykę. Obecne wykrywanie SARS-CoV-2 w ściekach opiera się głównie na metodzie RT-PCR, która jest pracochłonna, kosztowna, czasochłonna i pracochłonna.
Amplifikacja izotermiczna, w której pośredniczy pętla odwrotnej transkrypcji (RT-LAMP) jest obecnie szeroko stosowany jako idealna alternatywa dla RT-PCR, ponieważ RT-LAMP jest szybkim, tanim, specyficznym, czułym i łatwym w użyciu testem. RT-LAMP może bezpośrednio wykrywać SARS-CoV-2 z próbek klinicznych bez potrzeby ekstrakcji wirusowego RNA. RT-LAMP jest obecnie używany do wykrywania SARS-CoV-2 w próbkach ścieków.
RT-LAMP ma kilka innych zalet, takich jak wyłączenie termocyklera, czułość, szybkość i solidność inhibitora próbki, co czyni go idealną alternatywą dla RT-PCR. Amplifikacja izotermiczna za pośrednictwem pętli zajmuje mniej niż godzinę, aby powielić materiał genetyczny patogenu, z czterema do sześcioma starterami zapewniającymi wysoką specyficzność.
Mikrofluidyka to nowa, jednorazowa i niedroga technologia do szybkiego diagnozowania infekcji wirusowych. Technika mikroprzepływowa stanowi alternatywę dla czasochłonnych i pracochłonnych testów laboratoryjnych.
Technologie mikroelektroniczne i systemy mikroelektromechaniczne odgrywają kluczową rolę w opracowywaniu chipów mikroprzepływowych, które mogą obsługiwać precyzyjne objętości cieczy i wydobywać z nich informacje, zapewniając możliwość szybkiego uzyskiwania informacji z dokładnej objętości próbek. Dunia i jej współpracownicy połączyli RT-LAMP i technologię mikroprzepływową, aby wykryć SARS-CoV-2 w ściekach..
Bibliografia
- Dunia, A.; Hassan, Sz. Zhang, X; Madbouly, L.; Bukhari, H.; Kryzys związany z COVID-19 stwarza szansę na globalny nadzór i nadzór. Patogeny. 2021, 10256 https://doi.org/10.3390/pathogens10030256
- Kitajima, M. i in., SARS-CoV-2 w ściekach: stan wiedzy i potrzeby badawcze. nauka o makrośrodowisku2020.739: str. 139076. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2020.139076
- Oran, DP i EJ Topol, Bezobjawowe rozprzestrzenianie się zakażenia SARS-CoV-2. Roczniki Chorób Wewnętrznych2021. 174(2): str. 286-287. https://doi.org/10.7326/M20-3012
- Alhuraimel, K i in., SARS-CoV-2 w środowisku: sposoby przenoszenia, wczesne wykrywanie i potencjalna rola infekcji. nauka o makrośrodowisku, 2020: s. 140946. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2020.140946
- Ong, Chun Weixiang, Yian Kim Tan, Bo Ying Chia, Tao Hong Lee, On Teck Ng, Michelle So Yen Wong i Kalisfar Marimuthu. „Zanieczyszczenie powietrza, środowiska powierzchniowego i środków ochrony indywidualnej przez wirusa zespołu ostrej niewydolności oddechowej 2 (SARS-CoV-2) od pacjenta z objawami”. gamma 323, nr. 16 (2020): 1610-1612
- doi: 10.1001/Zbierz.2020.3227
- Dunya, Ahmed i inni. „Integracja RT-LAMP i technologii mikroprzepływowej do wykrywania SARS-CoV-2 w ściekach jako zaawansowany punkt opieki”. bioRxiv (2021). https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.08.18.456880v2
Dalsza lektura
„Całkowity miłośnik kawy. Miłośnik podróży. Muzyczny ninja. Bekonowy kujon. Beeraholik.”
More Stories
Czy zagadka pięknego, odwróconego drzewa została rozwiązana? Nowe badanie odkrywa tajemnicę Wiadomości wiedzy
Łazik NASA VIPER przygotowuje się do ostatecznego wyzwania kosmicznego
Wśród starszych Australijczyków kwitnie różnorodność kulturowa i językowa