Wzmacnianie potencjału genomiki patogenów w zakresie nadzoru jelitowego w regionie Azji i Pacyfiku: szkolenie PulseNet w regionie Azji i Pacyfiku

Pod koniec 2022 r. profesor Ben Howden i Tuyet Huang z Laboratorium Zdrowia Publicznego Jednostki Diagnostyki Mikrobiologicznej (MDU PHL) zostali mianowani nowymi współkoordynatorami PulseNet Asia Pacific, regionalnego ramienia PulseNet International – sieci krajowej i regionalne laboratoria zajmujące się śledzeniem infekcji przenoszonych przez żywność na całym świecie. Od tego czasu MDU PHL i Centrum Genomiki Patogenów (Centrum) gościły dwie grupy stażystów z dziewięciu krajów.

Tegoroczne szkolenie, które odbyło się od 31 stycznia do 8 lutego w Instytucie Doherty w Melbourne, nie miało mieć jedynie charakteru edukacyjnego. Jest to ważny krok w kierunku Studium Wykonalności PulseNet, którego celem jest zbudowanie możliwości sekwencjonowania genomu, szczególnie na potrzeby monitorowania oporności na środki przeciwdrobnoustrojowe patogenów jelitowych za pośrednictwem programu Globalne Laboratorium Oporności na Środki Przeciwdrobnoustrojowe i Sieć Reagowania, a także stanowi doskonałą okazję do nawiązania kontaktów dla członków PNAP z całego świata. kula ziemska, świat. Region.

Dwunastu naukowców z laboratoriów zajmujących się zdrowiem publicznym i badaniami medycznymi w Bangladeszu, Sri Lance, Wietnamie i Japonii wzięło udział w szkoleniu na temat metod sekwencjonowania całego genomu na potrzeby procedur zdrowia publicznego. Obejmowało to szkolenie w laboratorium mokrym w zakresie ekstrakcji DNA do sekwencjonowania, przygotowania biblioteki Illumina i sekwencjonowania na instrumencie Illumina MiSeq, a następnie szkolenie w laboratorium suchym w zakresie bioinformatyki i epidemiologii genomicznej.

Współpraca Centrum i MDU PHL z licznymi ekspertami i trenerami wnosi do programu bogatą różnorodność wiedzy i doświadczenia, a połączenie wiedzy wewnętrznej i zewnętrznej podkreśla siłę inicjatywy wynikającą ze współpracy.

Hosseini Walbula, jeden z głównych animatorów programu szkoleniowego, mówił o znaczeniu tych działań dla regionu.

„Takie szkolenia podnoszą umiejętności przyszłych liderów genomiki patogenów, ale także wzmacniają komunikację i współpracę w regionie” – powiedziała pani Walpola, specjalistka ds. szkoleń z zakresu genomiki w Centrum Genomiki Patogenów.

„To szkolenie promuje harmonizację protokołów sekwencjonowania całego genomu w regionie, a także ma na celu utworzenie grupy trenerów w dziedzinie genomiki patogenów, którzy następnie będą rozpowszechniać szkolenie w swoich krajach”.

„Naszym celem jest wzmocnienie pozycji laboratoriów w regionie i wyposażenie ich w umiejętności potrzebne do reagowania na zagrożenia zdrowia publicznego przy wsparciu sieci”.

Tweet Huang, kierownik genomiki patogenów i współkoordynator PNAP, MDU PHL, skomentował znaczenie tego szkolenia.

„Zapewniając możliwości nauczania i szkolenia laboratoriom w naszym regionie, nie tylko budujemy potencjał, ale także wzmacniamy społeczność praktyków w całym regionie Azji i Pacyfiku, aby usprawnić reagowanie na choroby enteropatogenne i nadzór nad nimi” – powiedziała.

Angela Boates, główna specjalistka ds. NGS i bioinformatyki w APHL, podzieliła się spostrzeżeniami na temat wpływu programu.

„Ta inicjatywa nie tylko rozwija umiejętności, ale także zachęca do kultury ciągłego uczenia się i współpracy w obliczu ewoluujących patogenów” – zauważyła pani Poates.

Bera (A) Hemarajatta, doradca techniczny w Laboratorium Azji Południowo-Wschodniej, APHL, również mówiła o szerszych celach programu.

„Naszym celem jest utworzenie silnej sieci wykwalifikowanych specjalistów w regionie Azji i Pacyfiku, którzy mogą przewodzić w ustanawianiu i wzmacnianiu wysiłków w zakresie nadzoru genomiki patogenów w swoich krajach”.

Inicjatywa odzwierciedla wspólne wysiłki kilku organizacji zajmujących się poprawą wyników w zakresie zdrowia publicznego poprzez wdrożenie WGS. Wspólny charakter tego szkolenia podkreśla globalne zaangażowanie w zarządzanie chorobami jelitowymi i promowanie bezpieczeństwa zdrowotnego w całym regionie Azji i Pacyfiku.

Organizacje biorące udział w szkoleniu:

Jednostka Diagnostyki Mikrobiologicznej, Laboratorium Zdrowia Publicznego (MDU PHL) w Instytucie Doherty, Melbourne, Australia

Centrum Genomiki Patogenów w Instytucie Doherty w Melbourne, Australia

Theagen Genomics, Kolorado, USA

Stowarzyszenie Laboratoriów Zdrowia Publicznego (APHL), Maryland, USA

Centra Kontroli i Zapobiegania Chorobom (CDC), Atlanta, USA

PulseNet Azja i Pacyfik

Międzynarodowa sieć impulsów

Instytut Badań Medycznych, Kolombo, Sri Lanka

Narodowy Instytut Chorób Zakaźnych, Tokio, Japonia

Instytut Pasteura, Ho Chi Minh, Wietnam

Narodowy Instytut Higieny i Epidemiologii, Hanoi, Wietnam

Międzynarodowe Centrum Badań nad Chorobami Biegunkowymi, Dhaka, Bangladesz