Wirus SARS-CoV-2 przenoszony drogą powietrzną jest często wykrywany w środowiskach, w których przebywają dzieci i osoby starsze, ale prawdopodobnie nie jest zakaźny, Norwegia, 2022 | Dziennik wirusologii

Po zniesieniu wszystkich ograniczeń związanych z COVID-19 w Norwegii i braku obowiązku używania masek, nawet w placówkach opieki zdrowotnej, obecne badanie ma na celu ocenę obecności SARS-CoV-2 w próbkach powietrza z różnych miejsc w pomieszczeniach i na zewnątrz, w tym zarówno placówki służby zdrowia. Niezwiązane z opieką zdrowotną. Odkryliśmy, że spośród 31 próbek powietrza tylko cztery wykazały obecność RNA SARS-CoV-2 metodą RT-qPCR, bez amplifikacji po wstępnej obróbce RNAzą, co zdecydowanie sugeruje brak żywotnego wirusa w tych czterech próbkach.

Cztery próbki pozytywne pochodziły z przedszkola (n = 2), domu opieki (n = 1) i poczekalni pediatrycznej w przychodni zdrowia (n = 1). Należy zaznaczyć, że w dniu pobrania próbek w przedszkolu większość dzieci wykazywała objawy chorób układu oddechowego, jednak żadne z nich nie nosiło maseczek. Ponadto w domu opieki dzień wcześniej jeden z personelu pielęgniarskiego uzyskał pozytywny wynik testu na obecność Covid-19.

Należy zauważyć, że liczba osób obecnych w każdym miejscu pobierania próbek zmieniała się w trakcie okresu pobierania próbek w każdym miejscu, ponieważ miejscami pobierania próbek były albo zewnętrzne miejsca publiczne o ciągłym i gęstym przepływie ludzi, takie jak parki publiczne lub stacje kolejowe, lub w pomieszczeniach zamkniętych Miejsca o stałym, ale nie dużym przepływie ludzi, np. przychodnia zdrowia, gdzie pacjenci stale przychodzą i wychodzą. Jednakże w miejscach, w których można było ekstrahować RNA SARS-CoV-2 z próbek powietrza, gęstość obecnych osób była niska (tj. podczas pobierania próbek w tych miejscach przebywało mniej niż 15 osób).

Patrząc na te wyniki, choć wskazują one na obecność niezakaźnych wirusów w próbkach powietrza, nie możemy wykluczyć, że proces pobierania przyczynił się do inaktywacji SARS-CoV-2. [24]. Do zmniejszenia żywotności wirusa może przyczyniać się wiele czynników, w tym proces agregacji i długotrwałe przebywanie w powietrzu (co zwiększa prawdopodobieństwo uszkodzenia powierzchni w wyniku uderzenia, narażenia na szkodliwe zanieczyszczenia unoszące się w powietrzu, odwodnienia lub zniszczenia). [25]. W przypadku cyklonowego urządzenia do pobierania próbek Coriolis Compact w pobliżu wejścia cyklonu wtryskiwana jest warstwa cieczy w celu zwilżenia ścian cyklonu, która następnie jest zbierana u podstawy cyklonu do analizy. Uważa się, że zwiększa to żywotność cząstek wirusa lub innych zagregowanych mikroorganizmów, z których pobierane są próbki, ale siły ścinające mogą nadal zmniejszać żywotność cząstek [26,27,28].

Ponieważ prawdopodobieństwo wykrycia zakaźnego SARS-CoV-2 jest bezpośrednio powiązane z ilością wirusowego RNA wykrytego metodą RT-qPCR, prawdopodobieństwo wykrycia zakaźnych wirusów jest większe, gdy wirusowy RNA jest obecny w stężeniach większych niż 1 × 10⁶ Kopie genów/ml [29]w naszym badaniu nie spodziewaliśmy się żadnych żywych wirusów, biorąc pod uwagę małą liczbę kopii genów/m³ jest znalezione. Jest to spójne z wcześniejszymi badaniami nad SARS-CoV-2, w ramach których zidentyfikowano żywego wirusa w próbkach powietrza [30,31,32]z 1000 kopiami genów/m³ [31]. Należy zauważyć, że w innym badaniu stężenie RNA oszacowano na 2,5 × 102⁵ Liczba kopii RNA/ml miała wskaźnik powodzenia w izolowaniu zakaźnego wirusa wynoszący mniej niż 5%. [33]. W innym badaniu, przy wskaźniku powodzenia izolacji wirusa zakaźnego wynoszącym mniej niż 5%, wartość graniczna wynosiła 4,3 × 10⁶ Kopie RNA/ml [34]. Wszystkie te wartości są zgodne z innymi badaniami, które wykazały, że jest mało prawdopodobne, aby próbki o wartościach Ct > 24 po posiewie dały wynik pozytywny na obecność wirusa. [35]. Należy jednak podkreślić, że pomiary Ct zależą od testu RT-qPCR i zastosowanej platformy [36].

Informacje na temat wrażliwości wirusów SARS-CoV-2 w próbkach powietrza są bardzo ważne przy omawianiu oceny ryzyka, ponieważ badania oceny ryzyka są wykorzystywane przez decydentów i agencje ds. zdrowia do opracowywania strategii łagodzenia i zapobiegania w celu kontrolowania przenoszenia wirusa w społecznościach, a także jako jego wpływ. Zastosowania w higienie pracy [37]. W tym kontekście metoda wstępnej obróbki nukleazą stanowi alternatywę dla oszacowania obecności zakaźnych wirusów w próbkach powietrza, gdy posiew wirusa nie jest możliwy, umożliwiając lepszą interpretację badań dotyczących obecności SARS-CoV-2 w regionie. Co więcej, metoda ta może usprawnić analizy mające na celu wspieranie dochodzeń opartych na ryzyku, czy to w celu zapobiegania nowym ogniskom chorób, czy też leczenia powtarzających się przypadków, i może być stosowana w szerokim zakresie scenariuszy. [38].

SARS-CoV-2 zwykle powoduje łagodną chorobę i niewielką liczbę zgonów u dzieci i młodzieży w porównaniu z dorosłymi [39]. Grupy te pozostają jednak podatne na zakażenie SARS-CoV-2 i mogą przenosić wirusa na inne osoby, np. osoby starsze, zwiększając obciążenie systemami zdrowia publicznego (WHO) chorobami. [40]). Co ciekawe, nasze wyniki sugerują związek pomiędzy obecnością SARS-CoV-2 w powietrzu w środowiskach, w których występuje większa liczba dzieci poniżej trzeciego roku życia, które do dziś stanowią na całym świecie grupę wiekową, w której występuje większa liczba dzieci. O ludziach, którzy nie są odporni na wirusa koronowego. 19 [41, 42].

Jednakże zsekwencjonowana próbka wykazała mutacje nukleokapsydu R203K (28881G>A, 28882G>A) i G204R (28883G>C), które według doniesień zwiększają zakaźność, sprawność i zjadliwość SARS-CoV-2. [43]gdyż wiąże się ze zwiększoną liczbą zakażeń szczepami SARS-CoV-2 w Stanach Zjednoczonych (USA), a także jest powszechna zarówno w USA, jak i w Europie [44]. Mutacja G204R jest niekonserwatywna i stwierdzono, że mutacja R203K działa jako wariant niekonserwatywny ze względu na różną wielkość reszt argininy (R) i lizyny (K) oraz znacząco różne właściwości chemiczne grupy bocznej łańcuchowa grupa guanidyniowa (arginina) w porównaniu z aminą pierwszorzędową (lizyna). Postawiono hipotezę, że mutacje te mogą wpływać na ciężkość choroby poprzez zmianę elastyczności i dynamiki regionu łącznika, co z kolei zmieni funkcję nukleokapsydu. [45].

Jedno z ważnych pytań bez odpowiedzi dotyczących epidemiologii COVID-19 dotyczy roli dzieci w przenoszeniu wirusa SARS-CoV-2. [46]czyli grupę stanowiącą dużą część populacji w wielu krajach (Charumilind i in. [47]). W miarę rozwoju łagodniejszych objawów dzieci poddaje się badaniom rzadziej, a przypadki mogą pozostać niezgłaszane (WHO) [40]), dzięki czemu wirus może dotrzeć do grup najbardziej narażonych na zakażenie, takich jak osoby starsze i osoby z obniżoną odpornością. Ostatnie doniesienia sugerują również, że wariant Omicron i jego podszczepy mogą prowadzić do częstszych hospitalizacji dzieci, przy czym dzieci stanowią większą część pacjentów hospitalizowanych z powodu Covid-19 niż w poprzednich falach zakażeń wywołanych innymi budzącymi obawy wariantami. [41]. Ponadto rozważając możliwość wykrycia RNA SARS-CoV-2 w placówce domu opieki, poddaje w wątpliwość obowiązujące wówczas wytyczne w zakresie profilaktyki, jeśli chodzi o bezpieczeństwo osób starszych, zgodnie z wcześniejszymi danymi epidemiologicznymi z Norwegii . Pokazują, że większość zgonów związanych z Covid-19 należy do tej grupy ryzyka [48].

Jednakże dotychczasowe dowody w dalszym ciągu sugerują, że dzieci nie należą do głównych czynników wywołujących epidemię [49]. Do tego dochodzi fakt, że u dzieci bezobjawowych miano wirusa jest znacznie niższe w porównaniu z dziećmi z infekcjami objawowymi. [50] Spowodowało to, że mniej wysiłku włożono w zrozumienie roli dzieci w przenoszeniu SARS-CoV-2 drogą powietrzną [51].

W innym badaniu podkreślono, że chociaż szacunki dotyczące podatności dzieci na zakażenia są niższe niż w przypadku dorosłych w gospodarstwie domowym, należy pamiętać, że na ich rolę w rozprzestrzenianiu się SARS-CoV-2 wpływają również różne wzorce kontaktów i nawyków higienicznych poza domem (Dattner i in. [46]). Na przykład intensywny kontakt i mieszanie się dzieci w porównaniu z dorosłymi w szkołach może zrównoważyć efekt zmniejszonej podatności. W przeglądzie zwrócono uwagę na fakt, że około połowa populacji USA uczęszcza do szkoły, pracuje w szkole lub ma kontakt pierwszego stopnia z osobami często uczęszczającymi do tych placówek, co sugeruje, że transmisja w szkole może wpływać na rozprzestrzenianie się choroby zakażenie w szkole. Obciążenie chorobami w okolicznych społecznościach [52]. Budzi to alarm o większej możliwości rozprzestrzeniania się wirusa w szkołach, gdyż zawierają one jeden z kluczowych elementów zjawiska superrozprzestrzeniania się, jakim jest długotrwałe narażenie na kontakt z innymi ludźmi w pomieszczeniach zamkniętych. To, czy szkoły te mają odpowiednią wentylację, to kolejny czynnik, który należy wziąć pod uwagę przy ocenie ryzyka narażenia w szkołach. Innym ważnym czynnikiem związanym z dziećmi i zwiększonym ryzykiem zakażenia SARS-CoV-2 jest to, że w rodzinach z dziećmi w społecznościach o niskich dochodach i w miastach bardzo wysoki jest odsetek wtórnych ataków rodzinnych, a dzieci odgrywają ważną rolę jako przypadki indeksowe. [51].

Badanie to podkreśla obecność SARS-CoV-2 w środowiskach wewnętrznych i zewnętrznych, ze szczególnym uwzględnieniem placówek opieki zdrowotnej i innych. Po zniesieniu ograniczeń związanych z Covid-19 i zaszczepieniu dużej części populacji nasze odkrycia dostarczają cennych informacji na temat dynamiki przenoszenia SARS-CoV-2 w czasie, gdy zniesiono wszystkie ograniczenia, a stopień wyszczepienia jest wysoki.

W Norwegii próbki powietrza pobrano w dwóch miastach, Oslo i Ase, na przełomie kwietnia i maja 2022 r. W tym okresie systematycznie spadała liczba nowych pacjentów przyjmowanych do norweskich szpitali z powodu koronaawirusa. 19, przy większej liczbie przyjętych nowych pacjentów na 100 000 osób w grupach wiekowych 75-84 i ≥85 lat [19]. Należy zaznaczyć, że w tym okresie 58% osób, które zmarły w wyniku powikłań związanych z Covid-19, zmarło w placówce opieki zdrowotnej innej niż szpital, zwłaszcza w domach opieki. Wariant Omicron BA.2 był dominującą sublinią w kraju i stanowił 95-100% wszystkich próbek sekwencjonowanych całego genomu w tym okresie [19].

Biorąc pod uwagę, że nasza kampania pobierania próbek miała miejsce w czasie, gdy w Norwegii transmisja próbek była niska oraz że pobieranie próbek obejmowało różne miejsca w pomieszczeniach i na zewnątrz (parki publiczne, stacje transportu publicznego, stołówki uniwersyteckie, dom opieki, przedszkole i przychodnia zdrowia) ), fakt, że RNA SARS-CoV-2 można wykryć jedynie w miejscach związanych z dziećmi i osobami starszymi, rodzi pewne problemy, jeśli chodzi o wytyczne dotyczące łagodzenia skutków i strategie zapobiegawcze.

Po pierwsze, w miarę jak zwiększa się liczba szczepień na całym świecie i zaczynamy wracać do normalności sprzed epidemii Covid-19, liczba przypadków Covid-19 rośnie, a nadzór nad SARS-CoV-2 maleje, co kształtuje nadchodzącą dla Europy pełną wyzwań zimę. [53]. Jednakże pilnie konieczne jest, aby kraje w regionie UE wznowiły wysiłki łagodzące i były przygotowane do zareagowania na rosnące obciążenie ich systemów opieki zdrowotnej.

Wdrożenie tego, co Światowa Organizacja Zdrowia nazywa „pięcioma P pandemii” (zwiększenie wskaźników szczepień, druga dawka przypominająca dla osób z obniżoną odpornością i ich bliskimi kontaktami, noszenie maseczek w pomieszczeniach i w środkach transportu publicznego, poprawa wentylacji w zatłoczonych i publicznych miejscach oraz wdrożenie protokoły Rygorystyczne leczenie (w przypadku osób zagrożonych poważną chorobą) będzie miało ogromne znaczenie w celu kontrolowania przenoszenia wirusa jesienią i zimą. [53].

Biorąc pod uwagę, że dzieci nadal stanowią większość nieszczepionych osób nie tylko w regionie UE, ale w skali globalnej, a także fakt, że grupa ta często przebiega bezobjawowo i jest rzadziej poddawana badaniom, należy zwrócić szczególną uwagę na znaczenie ponownego wdrożenia maski noszenie w pomieszczeniach i na zewnątrz Transport publiczny, ponieważ pozostaje jedną z najskuteczniejszych metod zapobiegania przenoszeniu SARS-CoV-2 drogą powietrzną [54, 55]. Ograniczyłoby to przenoszenie wirusa na dzieci, co z kolei pomogłoby zapobiec rozprzestrzenianiu się wirusa z tej grupy na grupy szczególnie wrażliwe, takie jak osoby starsze i osoby z obniżoną odpornością. Co więcej, biorąc pod uwagę wzrost liczby Omicron i jego łatwo przenoszonych podszczepów, przywrócenie noszenia masek może być najlepszą strategią kontrolowania przenoszenia się COVID-19 w społeczeństwie. [55].